Se firmó un Acuerdo de Cooperación Científica y Técnica en 1992. La primera reunión de la Comisión Mixta se realizó en Bogotá en 2006 y la segunda reunión tuvo lugar en Rabat en 2020.
Como producto de la segunda reunión de la Comisión Mixta realizada en Rabat en 2020, se adoptó un programa de cooperación bienal 2020-2022 incluyendo 7 proyectos, a saber: 1) Fortalecimiento de Cadenas Productivas para el desarrollo y mejoramiento de técnicas agrícolas; 2) Refuerzo de los medios y protocolos de seguridad sanitaria y fitosanitaria; 3) Fortalecimiento de la policía judicial; 4) Fortalecimiento de la cadena de valor artesanal y esquemas de capacitación técnica para el trabajo; 5) Fortalecimiento de capacidades para la conservación, gestión y comunicación del patrimonio cultural en Marruecos y Colombia; 6) Turismo sostenible de naturaleza en zonas desérticas; 7) Intercambio de saberes sobre el futbol infantil y juvenil.
El 12 de mayo de 2022 se realizó una reunión de evaluación de la ejecución del programa de cooperación en la que ambos países señalaron la importancia de iniciar la implementación de aquellos proyectos que por la pandemia no pudieron ejecutarse y culminar los que aún tienen actividades pendientes.
Por otra parte, Colombia y Marruecos han venido identificando en el último año sectores prioritarios en los que se busca promover la cooperación bilateral. Entre estas áreas se destacan las siguientes:
- Telecomunicaciones, manufactura, infraestructura y logística
- Energías Renovables e Hidrógeno Verde
- Programas de asistencia agrícola y agroindustria
- Investigación sobre vacunas entre Marruecos y Colombia.
- Proyectos que fortalezcan la equidad y el empoderamiento de la mujer.
